Le Pérou offre également la possibilité d'observer des animaux dans leur milieu naturel.
Au sud du pays, vous pourrez être amenés à traverser la Réserve nationale "Salinas y Aguada blanca" où les vigognes (sauvages) paissent tranquillement. Cette zone est également fréquentée par des éleveurs d'alpagas.
La Croix du condor est un endroit privilégié au sud du Pérou dans le Canyon de Colca pour observer les condors évoluer dans leur milieu naturel.
Autre endroit merveilleux, les Iles Ballestas. Depuis Paracas, vous pourrez embarquer sur une petit bateau afin de faire le tour d'un monticule sur lequel vivent manchots de humbolt, otaries, sternes inca, etc.